先天性巨脑回畸形在治疗上较为困难，常用的方法包括以下几种：

1、如患儿存在智力、运动等方面的问题，主要以康复治疗为主，应定期找康复科医生进行评估。

2、癫痫发作的先天性巨脑回畸形患儿主要进行药物治疗，如果巨脑回的分布较为局限，或药物治疗效果不佳，可以进行手术治疗。

多数巨脑回为双侧分布，范围较广，以药物治疗为主，还可以进行生酮饮食、姑息性手术或神经调控等治疗。