性发育异常有可能影响身高，其与性发育异常的类型有关。

一般认为，决定身高的基因是在X染色体上。所以如果是X染色体异常所致的性发育异常患者，其身高可能受一定影响。例如，特纳综合征患者，由于缺失一条或一部分的X染色体，其身高相关的基因受影响，患者可表现为身材矮小。据观察，完全型的特纳综合征患者（45X染色体核型）在不治疗的情况下，身高一般不超过1.5米。如果能够及时发现、早期治疗，适当应用生长激素、雄激素或雌激素等，有可能促进患者的身高生长。