卵巢囊肿一旦明确诊断，除了生理性囊肿都应该手术治疗，而不是选择药物治疗。但是对于卵巢巧克力囊肿，术后需要辅助治疗。

1、卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位囊肿的一种，特点是容易复发。对于近期没有结婚计划或没有条件生育的患者，需要选择药物治疗，包括假孕药物和假绝经药物。

2、卵巢巧克力囊肿术后首选的治疗手段是尽早结婚生育，妊娠、生育是对本病最好的治疗。同时子宫内膜异位也容易造成不孕，结婚生育也是治疗子宫内膜异位的目的。