卵巢囊肿是否可以自愈需确定其是否为生理性囊肿。若为生理性的囊肿，是可以自愈的；若不是生理性囊肿，一般不会自愈。生理性囊肿一般发生在育龄期，大约为5~6公分。一般会在月经后消失或明显变小，有些人可能缩小的慢，但一般都可在三个月左右完全消失。发现卵巢囊肿时，应先通过超声检查以及妇科检查观察一段时间。若在月经后囊肿明显缩小或消失，通常可判断为生理性囊肿，一般不需要进行手术。反之，则需要明确诊断，进行相应的治疗。