由于白癜风的恢复需要依靠毛囊干细胞，而在肢端型白癜风发生的部位，毛囊干细胞数量较少，因此治疗相对困难。

白癜风的恢复需要毛囊干细胞分化为黑素母细胞，进而分化为黑素细胞，由黑素细胞再生成黑素，方可使皮肤颜色恢复正常。肢端型白癜风主要发生于手指、脚趾、手背、脚背、手掌、足底等部位，而这些部位的毛囊数量较少或是没有毛囊，毛囊干细胞数量不足，难以分化出足够的黑素细胞，故皮肤颜色难以恢复正常，预后较差。