中医治疗扁平疣具有更多的优势。在临床上，中医和西医均可用于扁平疣的治疗，医生通常根据患者的具体情况，选择合适的治法。

1、西医治疗扁平疣一般以局部治疗为主，包括外用腐蚀性药物或者应用冷冻、激光等物理方法。

2、中医治疗扁平疣主要是辨证治疗。若早期发病比较迅速，治疗以清热、解毒、祛风为主；若后期伤及气血，导致气阴不足，可应用补益药物，并配合活血通络的方法进行治疗。此外，还可采取中药外洗或外涂中药等方法，比如外涂鸦胆子油等。但上述药物均需在医生指导下使用，切不可自行用药治疗。