性病主要由病毒、细菌、真菌、寄生虫等病原体感染引起，医生通常根据不同的病原体来制定治疗方案。

1、由病毒感染引起的性病，主要进行抗病毒治疗。如生殖器疱疹常用伐昔洛韦、泛昔洛韦等抗病毒药物来治疗；艾滋病则主要用鸡尾酒疗法，即联合使用多种抗病毒药物。

2、细菌性的性病主要应用抗生素来治疗。如淋病可用头孢曲松钠、壮观霉素等。

3、由支原体、衣原体等感染引起的性病，常需应用四环素类、红霉素类等药物进行治疗。

4、由寄生虫感染引起的性病，主要应用抗寄生虫的药物来进行治疗。