中药、西药在治疗灰指甲方面各有一定的优势，患者应及时就医，在医生的指导下选择用药。
一、西药治疗
现代医学称灰指甲为甲癣，是由于真菌感染导致的指甲变色、变厚、变脆、脱屑等，还可继发甲沟炎等。目前主要通过系统内服和外用抗真菌的药物来治疗。
1、常系统内服特比萘芬、伊曲康唑等药物，但所需疗程较长。
2、常外用环利软膏等渗透性较好的药膏、含有促渗剂的搽剂等来治疗灰指甲。在使用这些外用药物时，应注意把指甲修薄，且在涂药后用封包的方法，以促进药物的渗透，从而发挥更好的治疗作用。如今还可使用甲油剂型等一些新的剂型，使药物长时间附着于指甲，从而发挥治疗的作用。
二、中药治疗
目前，中医药治疗灰指甲，以外治的方法为主。主要用凤仙花等有抗真菌作用的药材，常通过封包的方法来促进药物渗透。但治疗时间通常较长，需患者遵医嘱坚持治疗。