可变性红斑角化症是由于编码连接蛋白GJB3和GJB4的基因发生突变导致，常在环境因素诱导下发病。

正常情况下，皮肤角质形成细胞的细胞之间有一种连接通道，跨越两个细胞的细胞膜，使细胞间产生信息交流。若基因突变导致细胞间的连接通道异常，角质细胞间的信息交流产生障碍，可能引起皮肤过度角化、继发炎症，最终发生皮肤损害。

外界环境因素的改变，如日光照射、环境湿度变化、摩擦等，均可诱发可变性红斑角化症的出现。