红斑性肢痛症是常染色体显性遗传病，有可能遗传。红斑性肢痛症的发生，与2号染色体异常有关，如果父母患有红斑性肢痛症，则子女患病的风险也会增加。

染色体异常会导致钠离子通道功能障碍，使温度、震动等刺激阈值下降。较低的温度和运动刺激，就会影响到血管壁以及周围神经，引起皮肤潮红、灼热、疼痛等症状。因此患者要尽量避免相应的刺激因素，比如局部加热、震动、损伤等，以免症状出现。