肛窦炎主要由于细菌感染引起。肛窦的底部有肛腺导管的开口，正常情况下，肛腺会分泌肛腺液，起到润滑大便的作用。但由于肛窦开口向上，细菌容易进入肛窦，在里面繁殖生长，引起肛窦炎症。此外，以下两种情况可能会诱导肛窦炎的发生：

1、进食辛辣、刺激性食物，如辣椒、海鲜、肥腻食物等，可能会诱发肛窦炎；

2、溃疡性结肠炎、胃肠型感冒，或者饮食不洁，导致反复腹泻，而患者又不注意肛门卫生，也会诱发肛窦炎。