清咽滴丸为中药制剂，含有少量的甘草，根据中药“十八反”的合用禁忌，甘草不能与海藻、大戟、甘遂、芫花或其制品合用，如乳癖消片、祛痰止咳颗粒、宫炎康颗粒等。两者同服可能会产生毒副作用，影响身体健康。
患者服用该药期间也不宜同服滋补性中药，如人参、大枣、龙眼等，滋补药的药性偏温热，可能会加重体内的热证，不利于病情的恢复。本品与其他药物合用也可能会影响药效或增加毒副作用，因此服药期间请患者不要自行合用其他药物，如必须合用，请先咨询医生得到允许后再进行合用。
本品的中药成分较多，服用时不要与牛奶、饮料、茶水、绿豆汤等一起服用，避免其与药物有效成分结合后降低药效。患者在服药期间饮食宜清淡，避免食用辛辣、鱼腥、油腻食物，戒烟戒酒，以防加重病情，影响疾病治疗。服药3天后若症状不见好转或出现其他新的症状，应去医院就诊。