巴氏腺囊肿通过切开引流方法治疗，待切口愈合后，若囊肿内有部分活性腺体，则疾病有一定可能复发。此外，机体有两个巴氏腺，一侧治愈后，另一侧腺体也可能会患病，但该情况属于再发，不是复发。

巴氏腺腺管口阻塞，分泌物积聚于腺腔，可导致巴氏腺囊肿形成。若囊肿反复发作，或体积较大、引起不适症状、继发感染，严重影响日常生活，建议及时就医，酌情采用腺体切除术等方法治疗。