灰指甲的治疗方法包括局部用药、系统用药、非药物治疗及联合治疗，需根据个体病情针对性展开治疗。
一、局部用药：主要适用于轻症患者，可使用阿莫罗芬的甲涂剂、冰醋酸制剂等，但效果相对弱。
二、系统用药：大部分患者，只要无禁忌证，一般都建议系统性使用抗真菌药。常用药物有特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等，这些药物的疗效以及安全性均相对肯定。但患者不能随意用药，关于用药种类、剂量及疗程，应在专科医生指导下进行选择。
三、非药物治疗（主要作为辅助治疗）：
- 1、外科治疗，部分顽固甲癣患者，甲外伤后继发感染，或者出现嵌甲，或者出现明显甲畸形，可借助外科手段将病甲拔除、清理甲母。
- 2、激光治疗，可利用光热原理一直真菌，适用于不能耐受药物治疗的患者，但其可能有一定疼痛。
- 3、光动力疗法也有应用于临床，即涂抹光敏剂于病甲，再用特定光线照射以杀灭真菌的方法。
四、联合治疗：主要包括口服药物和局部外用药物的联合，口服药物和(或)外用药物与非药物治疗的联合，适用于病情比较严重的患者。
不同患者病情严重程度、病原菌种类、年龄及健康状况等都有差异，治疗方案的制定须充分考虑这些差异，以保障治疗的安全性和有效性，尤其是老年人、免疫低下者、慢性病患者。
