附件囊肿是否会影响怀孕，主要与囊肿性质、治疗情况等有关。

1、若为良性或生理性囊肿，则可能自愈或自行消失，通常不会对机体造成危害。

2、若为良性囊肿，且长期存在，体积较大，采用腹腔镜手术等方法治疗，一般不会对怀孕造成影响。

3、若囊肿为交界性或者恶性的肿瘤，可能会威胁孕妇身体健康，影响怀孕。

4、若囊肿因炎症引起，不及时治疗，可能影响卵巢和输卵管正常功能，导致不育。

5、部分病理性囊肿在早孕期增长较快，甚至还可能发生破裂或扭转等急症，对妊娠造成不良影响。

若发现囊肿，一般建议囊肿消除后，再考虑怀孕，以保证妊娠的顺利进行，避免不良情况发生。