原发性硬化性胆管炎的病因尚未完全明确，可能与以下因素有关：

1、遗传：原发性硬化性胆管炎是慢性胆汁淤积性疾病，特征是肝内外胆管进行性炎症和纤维化导致的多灶性胆管狭窄，具体病因尚不清楚，可能与遗传因素有关，临床上发现本病与溃疡性结肠炎关系密切。

2、感染：慢性、反复的细菌感染，进入到门脉循环，有可能诱发肝脏损伤，可能是原发性硬化性胆管炎的发病原因之一。

3、免疫因素：免疫介导的胆管损伤，可能是病因之一。