输尿管球囊扩张术的适应证相对明确。

既往临床研究显示，输尿管狭窄段越短，手术成功率一般越高。若输尿管狭窄超过2公分，球囊扩张基本都是失败的；若狭窄控制在1公分以内，则手术成功率约60%左右。也就是说，输尿管球囊扩张术的适应证为输尿管狭窄的长度不超过1~2公分，尤其是膜状狭窄、术后狭窄等相对简单的输尿管梗阻患者。

输尿管球囊扩张术的相对禁忌证是放疗后、肿瘤性或结核性等复杂狭窄，此类患者狭窄段大多较长、瘢痕也较厚，球囊扩张术的效果一般不好。若输尿管条件较差、较僵硬时，进行该手术，还容易将输尿管全程扩裂，导致尿液外渗。