细菌性阴道病患者应在医生的指导下进行以下治疗：
1、非孕期患者首选抗厌氧菌的药物，包括口服的甲硝唑、甲硝唑阴道栓剂、阴道泡腾片、林可霉素软膏等，还可以选择一些口服或栓剂的替硝唑、克林霉素类药物进行替代治疗。同时，患者还可以使用一些恢复阴道菌群正常的制剂，以调节阴道的微生态平衡。
2、由于细菌性阴道病可能导致胎膜早破、早产、产后感染等情况，所以，妊娠期患者可在医生的指导下使用相对安全的甲硝唑、克林霉素类药物治疗。哺乳期患者以使用甲硝唑阴道栓剂、2%克林霉素软膏进行局部治疗为宜，而应尽量避免全身治疗。
