肛瘘挂线的手术过程包括以下两部分：
一、在麻醉下进行挂线的过程。
1、如果是单纯挂线法，手术过程就是用探针从瘘管外口直接穿出内口，且探针的底端会挂上丝线，丝线的尾端会系上橡皮筋。当探针从瘘管穿出后，橡皮筋就会顺着丝线从瘘管内穿出。将两侧的橡皮筋结扎后，就会起到慢性切割的作用，最终会逐渐切开瘘管。
2、如果是切开挂线法，主要适用于长度较长，且位置很高的瘘管。手术过程就是先切开肛门直肠环外的瘘管，再用探针探入瘘管。当探针尾部的橡皮筋从内口穿出后，再将两侧的橡皮筋结扎。
二、手术后紧线的过程。
在肛瘘挂线手术后，随着时间的推移，挂线会逐渐变松，此时一般需要紧线。紧线时，一般用血管钳将橡皮筋拉紧，并用血管钳在靠近括约肌的部位固定橡皮筋，随后用丝线在血管钳下结扎橡皮筋，从而恢复橡皮筋的张力，使其再次起到切割组织的作用。
