灌肠分为不保留灌肠和保留灌肠，不保留灌肠一般不会对人的身体产生影响，保留灌肠本身对身体没有太大危害，可能只是刺激直肠或结肠黏膜。但是，如果保留灌肠的药物对身体有害，则会导致患者产生不适。
通过不保留灌肠，可以将通便剂经导管注入直肠或者结肠内，从而刺激肠蠕动，最终达到解除便秘或肠梗阻的目的。此外，也可通过不保留灌肠清洁肠道，为肠道手术做准备。
通过保留灌肠，可以将治疗溃疡性结肠炎的药物经导管注入直肠或结肠内，使药物直达病所。当药物通过肠道吸收后，便达到治疗疾病的目的。如果患者对灌肠药有所排斥，则灌肠药可能不会在体内保留，一般在注入肠道后便会被排出体外。
