长期大便不成形的治疗，首先要明确病因，然后根据病因进行针对性的治疗。例如：
一、如果是脾胃虚弱、消化不良所导致的长期大便不成形，则应该在医生的指导下，吃健胃消食片等有健脾胃、助消化作用的药物来治疗。临床上，中医中药的治疗效果通常比较好。
二、如果是感染所导致的长期大便不成形，则应该在医生的指导下，吃头孢等抗生素来治疗。
三、如果是寄生虫，如痢疾阿米巴所导致的长期大便不成形，则应该吃甲硝唑等有杀灭阿米巴原虫作用的药物来治疗。
四、如果是菌群失调所导致的长期大便不成形，则有以下几种治疗方法：
- 1、患者可以在医生的指导下，吃整肠生、金双歧等益生菌，来补充肠道菌群。
- 2、通过粪菌移植治疗，可能有一定的效果，但此种方法还在试用当中。
- 3、可以通过吃人参归脾丸、参苓白术散等中药来治疗。
五、要特别注意的是，如果是肠道肿瘤所导致的长期大便不成形，则必须进行手术治疗，才能彻底治愈大便不成形。
