孩子斜视的病因较多，包括中枢性、神经性、神经肌肉接头性、肌肉性等因素，但最主要的原因是大脑融合功能异常。

大脑融合功能异常时，无法正常协调双眼，会导致两个眼睛无法同时注视同一目标，其中一只眼睛呈游离状态。大脑融合功能异常主要由先天性因素引起，患儿会在不同的年龄段逐渐表现出斜视的症状，并非一出生就表现为斜视。

应注意，外伤、肿瘤以及糖尿病、甲亢等全身性疾病，也可能会引起斜视的表现。