甲真菌病的治疗主要可分为系统治疗、局部治疗和联合治疗三个方面。

1、系统治疗：由于甲板的解剖结构非常厚，所以，有时局部治疗达不到非常好的效果，而应以系统治疗为主，比如伊曲康唑、特比萘芬、氟康唑等药物。

2、局部治疗：局部治疗常为甲真菌病的辅助治疗，患者可在医生的指导下外用一些抗真菌的药物，比如5%阿莫罗芬甲搽剂等。有时，患者还可以联合激光、使用40%尿素乳膏进行化学溶甲等治疗。当甲板发生严重的继发细菌感染时，患者还可以进行拔甲治疗。

3、联合治疗：即局部治疗联合系统治疗，当甲真菌病损伤到甲根时，患者需要在医生的指导下进行联合治疗。