含铁血黄素沉着症（常由反复输血治疗导致）患者、血色病患者，以及其他非缺铁性贫血患者，禁用多维铁口服溶液。这些患者体内本就存在铁超负荷情况，或者属于平衡状态并不缺铁，再服本品补充铁，只会进一步加重原有病情，甚至引起致命危险。
由于多维铁口服溶液主要引起胃肠道反应，如恶心、呕吐、上腹部疼痛、便秘、黑便等，所以急性或消化道溃疡者应当禁用，否则药物会继续侵害溃疡面，使溃疡不易恢复甚至加重，而且还会加重患者胃肠道不适感，影响常规治疗。
此外，妊娠期妇女需慎用多维铁口服溶液，最好由医生指导。本品成分中维生素B6、烟酸都可能影响胎儿的正常发育，尤其如维生素B6，可导致新生儿维生素B6依赖综合征。新生儿维生素B6依赖综合征主要表现为患儿对维生素B6的需求量是正常新生儿的五到十倍，临床可表现为皮肤黏膜苍白或轻度黄疸、肝脾大、出血等。