绒毛膜癌的病因尚未明确，可能与妊娠相关因素或非妊娠相关因素有关。

1、90%甚至95%以上的绒毛膜癌都与妊娠有关。在流产或正常妊娠后，部分胎盘组织或滋养叶细胞可能发生癌变，从而形成绒毛膜上皮癌。

绒毛膜上皮癌是滋养细胞肿瘤的一部分。此外，侵蚀性葡萄胎也是一种滋养细胞肿瘤，可能是葡萄胎进一步侵蚀子宫，或者其他组织转移所导致。随着时间的发展，侵蚀性葡萄胎可能发展为绒毛膜癌。

2、非妊娠相关因素。可能与卵巢或子宫的生殖细胞有关，部分卵巢的生殖细胞会形成原发性绒毛膜癌。