进行羊膜腔穿刺术的最佳时间，通常由医生根据具体情况来确定。

1、若常规进行产前诊断，一般在中孕期进行羊膜腔穿刺术，即大约在18到20孕周左右。此时羊水量比较多、胎儿大小合适，更容易抽取羊水，还可降低流产、感染的发生风险。

2、若在晚孕期，怀疑胎儿存在一些病毒感染、有染色体或基因异常，也可进行羊膜腔穿刺术。通常需根据发现问题的时间、情况等，决定具体操作时间。