直肠绒毛状腺瘤一旦发现，应尽早展开治疗，因为该病是一种癌前病变，癌变率高，有研究表明，如果任其不管，10年以后极有可能发展成直肠癌。具体治疗应结合具体病情。

1、如果腺瘤体积较小，在1~2公分以下，可在消化内科结肠镜下做完整的切除，包括内镜下黏膜切除术EMR或者内镜下黏膜剥离术ESD 。

2、如果腺瘤体积较大，内镜下难以彻底切净，可以通过外科手术切除，主要术式包括经肛门的局部手术切除；经骶尾部入路的Kraske手术；经肛门括约肌的手术切除；经肛门内镜微创手术切除。

3、如果腺瘤体积超过三公分，局部切除难以切除干净，甚至已有局部癌变或已经癌变时，则要通过外科根治性手术的方法切除腺瘤，类似于直肠癌的根治性手术，一般有保肛的Dixon手术和不保肛的Miles手术。