肛瘘的病因包括：

1、肛周脓肿：肛瘘最主要的病因就是肛管或直肠周围的脓肿，也叫肛周脓肿，一般来源于肛腺。由于原发性或继发性感染，形成肛周脓肿，脓肿破溃或切开引流后，可能形成瘘管。

2、其他原因：少部分肛瘘可能由于其他原因所致，比如炎症性疾病（克罗恩病、溃疡性结肠炎）、肛裂反复刺激、长期痔疮、肿瘤等。

3、诱发因素：肛瘘还与某些诱发因素有关，包括不良的饮食习惯（比如嗜烟、嗜酒、嗜食辛辣刺激性食物），以及不良的生活习惯（比如久坐、熬夜、劳累）。