直肠神经内分泌肿瘤没切除干净的情况下，可做如下处理：

1、如果肿瘤来源于直肠，且体积在1公分以下，可选择经肛门内镜的微创手术，进行局部扩大切除。

2、如果肿瘤为G2、G3级，且切缘为阳性，不能排除淋巴结转移者，建议做根治性手术，将肠管切除，并做淋巴结清扫。

直肠神经内分泌肿瘤起病隐匿，可能在做结肠镜检查时偶然发现；也可能误认为直肠息肉，将病变切除后，切缘呈阳性，做病理检查后确诊。