复方消化酶胶囊（Ⅱ）应在餐前15分钟服用，最好用水整粒吞服。如患者存在吞咽困难，也可将胶囊打开，将小丸与水或流质食物同服。千万不要嚼碎小丸后服用，否则可导致药效降低。如果儿童要服药，可以将胶囊打开，把小药丸撒在少量液体上或者稀软的食物上给小孩送服，家长应提醒孩子不要用牙齿咀嚼，直接咽下。
作为非处方药，患者可以自行到药店购买复方消化酶胶囊（Ⅱ），参照说明书来服用。需要提醒患者注意的是，急性胰腺炎早期和对猪蛋白制品过敏者禁用；过敏体质者慎用；孕妇、哺乳期妇女应在医师指导下使用。由于本品与多种药物间存在相互作用，所以若您需要在用药期间，使用其他药物，请先咨询医生，避免出现联合用药风险。
部分患者在服用复方消化酶胶囊（Ⅱ）后出现了腹泻和肝功能指标（如谷草转氨酶）升高等副作用，通常情况轻微且可自行恢复。但每个人的体质和对药物的敏感度存在差异，如果您在用药期间出现任何严重、持续或进展性的症状，应及时就医。
