胃肠间质瘤常用的检查方法包括：
1、超声内镜：可判断肿瘤的部位、肿瘤起源与周围脏器的关系。
2、增强CT加三维重建：为胃肠间质瘤首选的影像学检查方法。可用于明确肿瘤的部位、大小、生长方式、血供、与周围脏器的毗邻关系、远处脏器的转移情况。
3、核磁：对于特殊部位的胃肠间质瘤，比如直肠、盆腔或肝脏转移者，具有重要意义；此外，核磁一般无辐射，适用于儿童、青少年等特殊人群。
4、PET-CT：适用于靶向药物治疗效果的早期评价，但因其价格较贵，目前尚未普及。
5、病理活检：肿瘤较大需做全胃切除的患者，建议在术前做病理活检，以明确诊断、判断基因突变的类型，从而指导术前辅助治疗、靶向药物的选择。常用方法为内镜引导下的穿刺活检、经阴道或直肠壁穿刺活检（适用于直肠或盆腔的间质肿瘤）。
