大黄蛰虫丸为破血除瘀类中成药。市面上常见的剂型有水蜜丸、大蜜丸等。水蜜丸温开水送服即可。大蜜丸通常可以嚼服，也可以掰成小块后，用水送服。本品为处方药，药物的用量、用药频次及疗程需要听从医嘱。临床医生一般会根据患者的病情、体质及用药耐受性等因素综合考虑指导相应的用药方案。
本品对用药时间没有严格要求，饭前饭后服用都可，对药物的疗效影响不大。但初次服用的患者可能会出现轻度腹泻，一周左右即可消失，症状比较严重的，应及时就医。
本品药性较强，不宜长期或过量服用，病情治愈后就应停止服用，以免损伤身体。服药期间，不宜食用任何寒凉的食物，以免影响药效。此外，大黄蛰虫丸有活血作用，可能会加重出血症状，如牙龈本身有出血的患者服药后出血量可能会增多，这一点需要注意。若服药后出现其他严重、持续或进展性的症状，应及时咨询医生。