黑斑息肉综合征的检查主要包括以下几个方面：

1、体格检查，主要是通过视诊，观察患者的皮肤黏膜有无特征性的黑斑。黑斑息肉综合征患者，常在手脚末端皮肤出现典型的片状、点状的黑斑，或者在嘴唇、口腔黏膜、舌头等部位也有黑斑。

2、内镜检查，包括胃镜和肠镜检查。在内镜下，可直接观察到胃黏膜、肠黏膜的息肉，以错构瘤性的息肉为主。小肠息肉更多见。

3、影像学检查，主要包括CT、造影等检查。

4、基因检测，如果检测出STK11基因突变可以确诊黑斑息肉综合征。