黑斑息肉综合征的治疗方案主要依据患者的临床表现严重程度而定。

一、如果患者仅有黑斑色素而没有息肉，一般多建议观察，无需特殊处理。

二、如果通过内镜检查等发现了息肉，则需根据息肉大小等选择不同的治疗方式。

1、若息肉大小在0.5cm以下，未造成明显症状，可暂不处理，密切观察息肉变化。

2、若息肉大小在0.5cm以上，可在内镜下切除息肉，以防止其持续增长，进而堵塞肠腔，造成肠套叠、肠梗阻等并发症。

3、若发现较晚，息肉体积已经很大，甚至已经形成肠套叠，或者已经出现恶变倾向，可通过外科手术治疗，包括开腹手术和腹腔镜手术。治疗过程中，医生会尽量保存肠管，将体积较大或者引发并发症的息肉逐个切除，对于体积较小的息肉可以后续择期行内镜下治疗。

黑斑息肉综合征是一个基因遗传病，基因治疗还没有实现，难以实现彻底根治。目前该病的治疗主要是针对去除息肉和缓解症状展开。