斑秃的病因尚不完全清楚，目前认为可能与免疫因素、遗传因素、精神心理因素、感染因素、某些非特异性刺激等有关，其中精神心理因素被认为是重要的诱发因素。
1、免疫因素。人体免疫系统的主要任务是识别和抵抗外界微生物的侵袭，但在某些情况下，由于免疫系统中的T淋巴细胞功能紊乱，导致不能分辨正常细胞而攻击毛囊，破坏正常毛囊的结构，使得毛囊不能正常生长，就会造成大量头发脱落，形成斑秃。斑秃常常并发甲状腺功能亢进、白癜风、红斑狼疮、干燥综合征等自身免疫性疾病。
2、遗传因素。斑秃的发生有一定的遗传基础。有研究显示，约25%的斑秃患者有家族史。基因完全相同的同卵双胞胎，其同时患斑秃的几率远远大于异卵双胞胎。
3、精神心理因素。沮丧、抑郁、焦虑、工作压力大等引起的精神应激，通常会诱发或者加重斑秃。
4、感染因素。斑秃可发生于带状疱疹、真菌感染、流感、梅毒等疾病后，可能与感染导致的机体免疫力下降有关。
5、某些非特异性刺激。局部创伤或手术等，可能引起毛囊上皮细胞的破坏，从而导致斑秃的形成。