毛囊炎和痘痘在病因、好发人群、发病部位及临床表现方面均有所不同。
1、病因不同：毛囊炎主要是因细菌、真菌等病原体引起毛囊感染所致；而痘痘的发生可能与雄激素水平、痤疮丙酸杆菌繁殖、遗传等有关。
2、好发人群不同：虽然二者任何年龄人群均可发病，但毛囊炎更好发于免疫力低下、患有慢性病、卫生较差、长期使用激素或免疫抑制剂药物等人群，而痘痘多发于15~30 岁的人群。
3、发病部位不同：毛囊炎好发于头面部、颈部、大腿、臀部、外阴及腋窝等部位；而痘痘则经常出现在面部、额头、胸部、背部和肩部，多为对称分布。
4、临床表现不同：毛囊炎常见表现为毛囊周围形成红色丘疹，并伴有红、肿、热、痛的炎症反应，严重时可出现化脓、破溃、坏死，有时还可能会导致瘢痕；而痘痘病变主要包括白头粉刺（白色丘疹）、黑头粉刺（有黑头）、丘疹、脓疱（丘疹顶端有“白帽"）、结节（皮肤表面坚硬而疼痛的肿块）和囊肿（皮肤表面下疼痛，摸起来有液体的肿块），常伴有毛孔粗大和皮脂溢出。