常见的肛门疾病有痔疮、肛周脓肿、肛裂、肛窦炎等。不同的疾病，其临床表现也有所不同。
1、痔疮：是最常见的肛肠疾病，是肛门和直肠处的静脉曲张团。患者易出现排便时出血、疼痛、肛门瘙痒、肛门潮湿、痔赘（俗称“肉赘儿”）脱垂等症状。
2、肛周脓肿：是直肠肛管周围软组织内或其周围间隙发生急性化脓性感染后形成的脓肿。患者可表现为肛门周围出现小肿块，突发剧烈疼痛，伴有局部发热、坐卧不安、夜不能眠，深部脓肿还会引起会阴、直肠部坠胀感，出现发热、寒战等全身中毒症状。
3、肛裂：是齿状线以下肛管皮肤层裂伤后形成的小溃疡。患者可有肛周疼痛、便秘和出血等症状。疼痛一般较剧烈，有典型的周期性，还可有肛门瘙痒等症状。
4、肛窦炎：是指肛窦、肛门瓣发生的炎症性疾病。患者可有肛门部不适、疼痛、肛门分泌物增加等症状。