肛门潮湿可用中药水洗，或者配合使用激素软膏、抗菌素软膏等。
1、中药水洗：常用苦参、芒硝、五倍子、地肤子、白鲜皮、蝉蜕、防风、蛇床子等药物，进行局部煎汤、外洗。但是水温不宜过高，一般坐浴15~30分钟，每天1~2次。中药水洗治疗肛门潮湿的效果较好。
2、外用药膏：临床常用如氧化锌软膏、水杨酸乳膏、复方多粘菌素B软膏、氢化可的松软膏、氟轻松软膏、克霉唑软膏等。一般尽量不用激素软膏，但如果瘙痒难忍时，也可使用激素软膏。部分患者在使用激素软膏后，肛门局部皮肤的抗菌能力减弱，因而还可配合应用抗菌素软膏（比如艾洛松、派瑞松或卤米松等）。但使用时间不宜过长，以免产生依赖性。
3、其他：还可以应用炉甘石洗剂等药物，起到收敛燥湿的作用。
除了上述药物治疗外，还需明确肛门潮湿的原因，并针对病因进行治疗。如果是肛瘘所致，需针对肛瘘进行治疗；如果是直肠癌所致，应积极治疗直肠癌；如果是肛窦炎或痔疮、肛乳头肥大脱出所致，也应进行相应的治疗。
