直肠指检的禁忌证包括绝对的禁忌证和相对的禁忌证两大类。

1、绝对禁忌证：如果直肠已经发生穿孔或有明显的外伤，那么不能进行直肠指检。而由于已经明确诊断为肛裂的患者进行直肠指检时会感觉非常痛苦，所以最好不要做。

2、相对禁忌证：对于一些处于急性炎症期或因对直肠指检不理解、有一些宗教信仰而拒绝做直肠指检的患者，也不能进行该检查。

总之，直肠指检在绝大部分情况下是一个安全有效的检查手段，但极个别的情况下也不能贸然进行。