胃肠道间质瘤与胃癌是两个不同的概念，两者的区别体现在以下几方面：

1、两者的发生部位不同，胃肠道间质瘤主要发生在胃壁或肠壁的间质部分，胃癌主要发生在胃黏膜；

2、两者的来源不同，胃肠道间质瘤来源于间质细胞肿瘤，黏膜可以是完好的，也可以出现溃疡，胃癌主要来源于胃黏膜上皮细胞的恶变；

3、两者的病因不同，胃癌的病因与炎症、溃疡、息肉、感染、遗传等因素有关，胃肠道间质瘤的病因尚未明确。