柴胡舒肝丸具有疏肝理气、消胀止痛的功效，用于治疗肝郁气滞导致的胸闷、胁肋胀满、食欲减退、嗳气、呕吐酸水、食滞不消等。
现代研究表明，本品能改善胃肠功能、抗肝纤维化、抗抑郁、调节机体免疫力，以及增加脑、肝血流量，改善脑、肝血循环等。临床上，还可用于治疗急/慢性胃炎、胃及十二指肠溃疡、慢性肝炎、慢性胆囊炎、经前期紧张综合征、睾丸炎、胆道蛔虫病等。另外，还可作为皮肤科用药，对黄褐斑、荨麻疹、黑变病有一定治疗作用。但需要注意，以上疾病均需要在医师辨证指导下应用本品治疗，患者不可擅自服用，以免耽误治疗或者增加用药风险。
患者通常可以根据自身的症状自行购买本品服用，用药前，应仔细阅读说明书，排除用药禁忌，减少用药风险。儿童、年老体弱者、孕妇、哺乳期妇女、月经量多者，以及高血压、心脏病、肝病、糖尿病、肾病等慢性病严重者，请在医师指导下服用本品治疗。