滑膜皱襞是由于在胚胎发育的过程中，很多间充质组织的隔膜退化不完全，在某些特定部位残留而形成的。

在胚胎发育的过程当中，膝关节内部是由很多纵隔分隔成的网状结构，就像由很多面墙壁分隔成的小房间，随着生长发育，这些纵隔会逐渐退化，融合成一个大的关节腔。到了成年之后，这些隔膜基本都会退变干净，但每个人的发育程度不同，有些人的纵隔不会完全退变，会残留在膝关节内，从而形成滑膜皱襞。