奥美拉唑是抑制胃酸分泌的药物，所以对与胃酸分泌过多引起的相关疾病都有治疗作用，如胃溃疡、十二指肠溃疡。奥美拉唑还可治疗胃食管反流症，这种疾病长期发展可能导致食管癌变，宜尽早治疗。对于查体发现幽门螺旋杆菌阳性的患者，建议根除幽门螺杆菌，通常用奥美拉唑与其他拉唑药物联合治疗。
奥美拉唑口服制剂可以作为非处方药自行购买使用，在使用前应详细阅读说明书。奥美拉唑口服制剂均为肠溶制剂，服用时注意不要掰开或嚼碎。奥美拉唑注射剂通常在医院等有医护人员的场所使用，相对有保障，但在用药前还是要和医生详细说明你的症状、疾病史和平时的饮食生活习惯等。