四神丸一般用于肾阳不足所致的泄泻，可表现为肠鸣腹胀、五更溏泻（黎明时分腹泻）、食少不化、久泻不止、 面黄肢冷等。以下为本品的禁忌：
1、本品药性偏温热，中医辨证属胃肠实热证（可表现为胃灼热痛、泛酸、烧心等）所致的腹泻及腹痛者不宜服用，以免加重病情。
2、孕妇应在医生权衡利弊之后再服用，以减少对胎儿的不良影响。
3、儿童、年老体弱者对药物常用剂量比较敏感，建议在医生指导下调整剂量后再服用。
4、哺乳期妇女及有高血压、糖尿病、肝病等严重慢性病者服用前，请先咨询医生。
5、本品含有肉豆蔻、补骨脂、五味子等中药成分，对本品成分过敏者禁用。第一次服用本品或属于过敏体质者，如出现皮疹、药物热或皮肤瘙痒等症状，请咨询医生。