病毒性角膜炎和细菌性角膜炎的区别主要在于二者的病因和临床表现不同。

1、病因不同：病毒性角膜炎是由病毒感染引起的，常见的病毒包括单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒以及巨细胞病毒等；而细菌性角膜炎主要是由细菌感染引起的，常见的细菌包括绿脓杆菌、葡萄球菌、肺炎球菌等。

2、临床表现不同：病毒性角膜炎可根据发病部位和层次分为上皮型、基质型和内皮型，其中上皮型一般为树枝状或地图状的，基质型常有基质的水肿，而内皮型可发现角膜水肿以及相应的角膜内皮面的有KP（角膜后沉着物炎症细胞）；而细菌性角膜炎通常比较严重，除了有角膜溃疡的形成外，还有大量的脓性分泌物。