耳朵畸形由遗传因素、染色体疾病、内外环境改变等原因所导致。如果母体在孕早期被病毒（如巨细胞病毒）、细菌感染，可能导致胎儿在子宫内受到挤压，此时胚胎发育可能会出现问题，最终会引起耳朵畸形的发生。此外，如果胎儿受到了电离辐射，或者父母亲在备孕期间经常吸烟、饮酒，也是引起胚胎发育异常的高危因素。