预防先天性膈疝和预防其他先天性发育不良没有太大区别，是一个普遍性预防措施，如改变生活方式、避免致畸环境、防止发生感染等。

1、怀孕早期要做一些准备，尤其是备孕期，可以口服小剂量叶酸，预防神经管和其他部位畸形。

2、年龄是导致染色体异常的重要原因，对于个人虽然没有办法做到预防，但从科普角度来讲，还是建议大家尽量避免高龄妊娠。

3、注意改变生活方式，不抽烟、不喝酒、禁止服用不必要药物，如果确实需要服药，应该及时咨询医生。

4、要尽量避免处于致畸环境，或者防止发生病毒感染等，这些都是预防先天性膈疝有效措施。

胎儿膈疝大多数由染色体异常导致，也有部分怀孕早期由于膈肌发育异常引起，因此，预防胎儿膈疝要在怀孕早期进行。