肛门脓肿手术后多久能愈合需视情况而定。

1、肛门脓肿通常需要进行切开引流，以肛周皮下脓肿或括约肌间脓肿为例，切开以后会形成十字或放射状的切口，将脓液排出后，在脓腔内进行油纱填塞，大概3天左右，将油纱取出，后期也可配合坐浴，通常需要2个星期左右，切口可以慢慢愈合。

2、但部分患者免疫力低下，或者合并克罗恩病等炎症性肠病，其愈合时间更长，可能需要1个月，甚至2个月左右才能愈合。

3、部分肛周脓肿切开引流以后，可能形成肛瘘，还需针对肛瘘进行治疗，愈合时间可能更长。