患者如果在服用脑蛋白水解物口服液期间同时服用抗抑郁药（如阿普唑仑、罗拉、丁螺环酮等），可能会出现精神紧张的情况，主要因为本品与这些药物发生了相互作用。如病情需要合用，一般情况下，医生会为患者调整抗抑郁药的用量。
患者使用脑蛋白水解物口服液前要向医生或药师仔细描述近期用药情况等，让医生或药师帮助排除用药禁忌，避免出现严重用药风险。在使用本品的过程中，若患者需要本品与其他药物合用，也请先咨询医生或药师，得到允许后再合用。
临床上，脑蛋白水解物口服液用于治疗先天性脑发育不全、中枢神经系统感染、老年性痴呆、颅脑外伤后遗症、脑血管损伤后遗症等疾病。其治疗新生儿缺氧缺血性脑病的疗效良好，可有效控制炎症反应，还能改善患儿的行为神经恢复及预后效果。