预防衣原体感染的措施主要有以下两个方面：

1、在普通人群中，部分人会携带衣原体。因此，要定期进行衣原体筛查，如果筛查后明确有衣原体感染，要及时进行药物治疗，且夫妻双方都要进行治疗，防止再次传染。

2、如果不清楚对方是否存在衣原体感染，在进行性生活时，一定要使用安全套，可以有效避免互相感染衣原体。